Faire infuser une petite quantité de racine séchée et concassée dans de l'eau chaude pendant une dizaine de minutes, puis filtrer. Se boit traditionnellement environ 20 à 30 minutes avant le repas pour stimuler l'appétit. Dosage à valider avec un professionnel de santé ou une pharmacopée reconnue avant usage.
La racine est macérée dans de l'alcool pendant plusieurs semaines puis filtrée. Cette forme concentrée, plus puissante que l'infusion, demande un dosage précis et l'avis d'un professionnel avant toute utilisation. Dosage à valider avec un professionnel de santé ou une pharmacopée reconnue avant usage.
La racine est mise à bouillir doucement quelques minutes dans l'eau afin d'en extraire pleinement les principes amers, puis laissée infuser avant d'être filtrée. Cette préparation plus concentrée que l'infusion simple était réservée à un usage occasionnel. Dosage à valider avec un professionnel de santé ou une pharmacopée reconnue avant usage.
On trouve la racine de gentiane jaune séchée en herboristerie et en pharmacie, ainsi que sous forme de teinture-mère ou d'extrait chez les herboristes spécialisés ; la cueillette sauvage est réglementée dans plusieurs régions de montagne où la plante est protégée.
La racine se récolte traditionnellement à l'automne, sur des plants âgés d'au moins trois ans, après la fonte des parties aériennes.